Есть интересные модули, сделанные с использованием jquery. Но в Joomla по умолчанию используется mootools.

Что делать?

 

 

Как это сделать (второй вариант), можно посмотреть на сайте jquery: http://api.jquery.com/jQuery.noConflict/

Примеры из описания noConflict:

Во многих библиотеках JavaScript используется $ как функция или название переменной, как и в JQuery. В случае  JQuery, $ это просто псевдоним для JQuery, поэтому все функции доступны без использования $. Если нам потребуется использовать другую JavaScript библиотеку совместно с JQuery , мы можем вернуть управление $ обратно в другие библиотеки с помощью $.noConflict ():

<script type="text/javascript" src="other_lib.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery.js"></script>
<script type="text/javascript">
  $.noConflict();
  // Здесь может быть код других библиотек, который использует $
</script>

В этом случае для jQuery кода вместо $ используется jQuery

	jQuery.noConflict();
// Do something with jQuery
jQuery("div p").hide();
// Do something with another library's $()
$("content").style.display = 'none';

Вместо jQuery можно использовать другое имя:

	var j = jQuery.noConflict();
// Do something with jQuery
j("div p").hide();
// Do something with another library's $()
$("content").style.display = 'none';

Так можно использовать код jQuery с $, когда DOM будет загружен:

<script type="text/javascript" src="other_lib.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery.js"></script>
<script type="text/javascript">
  $.noConflict();
  jQuery(document).ready(function($) {
    // Здесь jQuery's код, с $
  });
  // Здесь может быть код других библиотек, который использует $
</script>

jQuery с $

jQuery.noConflict();
(function($) { 
  $(function() {
    // more code using $ as alias to jQuery
  });
})(jQuery);
// other code using $ as an alias to the other library

и краткая запись jQuery с $:

jQuery.noConflict()(function(){
    // code using jQuery
}); 
// other code using $ as an alias to the other library